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由Sanford Burnham Prebys助理教授Lukas Chavez博士领导的研究人员正在利用最新技术对室管膜瘤进行前所未有的研究，这是最致命的儿科脑肿瘤之一。通过可视化基因组在肿瘤细胞内的组织和排列方式，他们能够揭示肿瘤中的基因，这些基因可能是未来治疗的靶点。结果发表在Nature Communications上。

“人类基因组由许多蛋白质编码基因和更多的非编码部分组成，这些部分都被紧密包装并卷绕起来以适应细胞的微小细胞核，”查韦斯说。“我们正在使用尖端技术来研究基因组的包装和卷曲方式，这为我们对基因调控机制提供了独特的视角。这种方法有助于我们了解基因组形状与癌症之间的联系。

脑和脊髓肿瘤，包括室管膜瘤，是14岁以下儿童最常见的恶性癌症，也是美国儿童期疾病亡的主要原因。

“室管膜瘤有许多不同的遗传和分子亚型，可以影响患者对治疗的反应，”查韦斯说。“目前的护理标准治疗包括手术后放疗，这承担了长期，治疗引起的神经系统副作用以及继发性癌症的风险。迫切需要新的、有针对性的室管膜瘤治疗选择。如果成功，我们的研究将导致新的，有效的药物来治疗这些危险的癌症。

研究人员专注于最常见和最具侵袭性的疾病形式，主要发生在幼儿身上。他们使用了一种称为3D基因组图谱的新兴技术，该技术可视化了细胞核内基因的组织方式。

“科学历来以二维方式研究基因组，重点是基因如何以长线性序列排列，”查韦斯说。“但是基因组和其他任何东西一样是一个3D物体，基因在空间中的排列方式对这些基因在体内的表达方式产生了影响。